В 2003 году российская премьер-лига решила организовать новый турнир, в котором бы клубы элитного российского дивизиона разыгрывали между собой трофей. Однако после первого же розыгрыша РФПЛ отказалась от дальнейшего проведения соревнования.

По регламенту в турнире участвовали только 16 команд премьер-лиги, которые по системе с выбыванием должны были определять лучшего. На каждой стадии плей-офф игралось по две игры (дома и на выезде), включая финал. Победитель Кубка не получал права на участие в розыгрыше Кубка УЕФА, а игры проводились в дни матчей сборной, поэтому большинство команды выставляло резервные составы. Как итог, турнир не получил особой популярности, а только загромоздил календарь, и в 2004 году было решено от него отказаться.

Победителем единственного Кубка российской премье-лиги стал питерский "Зенит", одолевший в финале новороссийский "Черноморец" со счётом 5:2 по сумме двух игр. Лучшим бомбардиром также стал представитель "Зенита" Владислав Радимов, на чьём счету было четыре гола.